Народився в Коломиї, 2 квітня 1961 року. Закінчив фізичний факультет Київського державного університету за фахом інженер-оптик-дослідник у 1983 році. Згодом – Інститут державного управління і самоврядування при Кабінеті Міністрів України за спеціальністю «економіка». Також здобув освіту – «управління територіями» – в Міжнародному інституті публічного управління в Парижі (1994–1995).

• 1990–1994 — депутат Хмельницької міської ради. 1991 року пішов у міську владу, і шість років пропрацював у її структурах.
• 1996–2008 — засновник ТОВ «Хмельницька інформаційна мережа».
• З 1997 року — в недержавних організаціях, працюючи консультантом програм американської допомоги Україна АМР (USAID). Пропрацювавши в цій організації шість років, Ганущак пішов у проєкти з охорони здоров'я.
• Один з розробників Бюджетного кодексу (під керівництвом Юлії Тимошенко) та учасник Групи експертів Ради Європи з питань впровадження Хартії місцевого самоврядування, консультант фракції «БЮТ/Батьківщина» у Верховній Раді України з питань бюджету та місцевого самоврядування.
• З 2003 до 2008 року — консультант Асоціації міст України з питань бюджету.
• З 2004 до 2006 року був менеджером з питань закупівель проєкту «Контроль за СНІДом і туберкульозом», що фінансувався Світовим банком.
• У 2006 році перейшов на роботу в Асоціацію міст України на пост експерта з питань бюджету.
• На дострокових парламентських виборах 2007 року (179 місце в списку БЮТ).
• У 2007 році Юрій Ганущак призначений на посаду директора департаменту місцевого самоврядування та адміністративно-територіального устрою Міністерства регіонального будівництва. Подав у відставку після призначення нового уряду.
• З 18 жовтня 2011 до 12 грудня 2012 — народний депутат України 6-го скликання. Член фракції «БЮТ – Батьківщина». Член Комітету з питань бюджету.
• Розробив ряд законопроєктів з питань реформування місцевого самоврядування, бюджету, державних закупівель. Один з розробників теорії децентралізації та територіальної організації виконавчої влади. Його розробки застосовуються при впровадженні реформи децентралізації в Україні.
• 22 лютого 2008 року Ганущак отримав 5 ранг держслужбовця, а 24 лютого 2010 року — 4 ранг.