Пятая часть данных в базах ДНК оказалась загрязненной

Ученые изучали генетические данные, которые содержатся в двух крупнейших базах ДНК – американской National Center for Biotechnology Information и европейской Ensembl. Оказалось, что в американкой базе неприсущие организмам человеческие геномы были обнаружены в 11% «завершенных» последовательностей и в 22 процентах так называемых исходных последовательностей – тех, из которых потом собирается «чистовой» вариант.

Европейская база оказалась загрязнена на 29%. Человеческие фрагменты оказались в ДНК ключевых сельскохозяйственных растений, а также в геномах многих модельных организмов, например червя Caenorhabditis elegans и шпорцевой лягушки Xenopus tropicalis.

Ученые предположили, что источником загрязнения могут быть мертвые клетки кожи, попадающие в пробирки с рук исследователей. И эта ситуация таит в себе серьезные опасности.

Дело в том, что ученые, которые сейчас работают над расшифровкой новых последовательностей, сверяют их с уже существующими в базе. И становится совершенно очевидно, что «грязь» в ДНК будет существенно влиять на результаты будущих исследований.

Более того, исходя из результатов новой работы, имеющиеся в базах последовательности ДНК людей могут также содержать в себе вкрапления ДНК ученых, которые делали анализ. Данная ситуация может негативно сказаться на будущем медицины, поскольку лечение многих заболеваний будет основано на анализе последовательности ДНК (терапия некоторых видов рака уже сейчас зависит от геномов раковых клеток).

По материалам The New York Times