Свято встановлене у пам'ять про розстріляних чеських студентів. 28 жовтня 1939 року в окупованій Чехословаччині празькі студенти і їхні викладачі вийшли на демонстрацію, щоб відзначити річницю утворення Чехословацької держави (28 жовтня 1918 року). Підрозділи окупантів розігнали демонстрацію, при цьому був застрелений студент медичного факультету Ян Оплетал.
Похорон Яна Оплетала відбувся 15 листопада 1939 року і переріс у акцію протесту. Десятки демонстрантів були арештовані. 17 листопада війська рано вранці оточили студентські гуртожитки. Більше 1200 студентів були заарештовані і поміщені у концтабір в Заксенхаузен. Дев'ятьох студентів і активістів студентського руху стратили без суду в застінках в'язниці в празькому районі Рузіне. За наказом Гітлера всі чеські вищі навчальні заклади були закриті до кінця війни.
На честь цих подій і був встановлений Міжнародний день студентів, а в післявоєнні роки його святкування підтверджено на Всесвітньому конгресі студентів, що відбувся в Празі у 1946 році, і з цього часу він відзначається щорічно.
В Україні святкування встановлено указом президента від 16 червня 1999 року.