Піраміда стала вже третьою структурною знахідкою в Кукулькана: про наявність всередині храму другої піраміди археологам було відомо ще з 1940-х років. До 2015 року дослідники за допомогою тривимірної електротомографії встановили, що Кукулькана стоїть над підземною річкою.
За словами археолога Денісс Арготе, вік найменшої внутрішньої піраміди може датуватися 500-800 роками нашої ери, і вона відноситься до періоду "чистих майя".
Раніше мексиканські археологи виявили тунель в піраміді ацтеків Уїцилопочтлі, яка розташовується в стародавньому місті Теночтітлані на території сучасного Мехіко. Тунель веде до двох закритих камер, які розташовуються на центральній площадці округлої форми.