Обсуждение предложений правительства по сокращению числа льгот и расширения базы налогообложения было весьма бурным. На утреннем заседании 3 апреля депутаты дважды голосовали по законопроекту об НДС в целом. Сначала за него проголосовали 226 депутатов. После этого председатель парламента Александр Мороз поставил законопроект на повторное голосование, поскольку председатель парламентской комиссии по вопросам чернобыльской катастрофы Владимир Яценко выразил несогласие с итогами первого.
При втором голосовании законопроект не набрал необходимого количества голосов, и было проведено совещание руководителей групп и фракций относительно голосования, после чего законопроект был принят.
Депутаты отклонили предложение правительства восстановить налогообложение работ по строительству жилья для военнослужащих, ветеранов войны и военных конфликтов. Согласно принятой норме, не облагается НДС выполнение таких работ за счет средств инвесторов. По предложению депутата Сергея Терехина, из закона исключена норма об освобождении от налогообложения товаров (кроме подакцизных), импортируемых объединениями граждан, пострадавших в результате аварии на Чернобыльской АЭС.
Несколько изменена редакция нормы, касающейся нулевой ставки НДС. По нулевой ставке взимается НДС с продажи угля, угольных и торфяных брикетов, концентратов и шлама, а также с продажи электроэнергии населению, причем это положение действует до 1 января 1999 года.
Парламент согласился с предложением правительства включить в закон норму о том, что импортеры для уплаты НДС могут предоставлять органам таможенного контроля простой вексель на сумму налогового обязательства.
Комментируя принятый закон, Сергей Терехин заявил, что «парламент убрал 2/3 всех льгот». Остались «всего две-три позиции, которые теоретически могут быть использованы для ухода от налогообложения», однако, по мнению депутата, при желании это «можно будет исправить на уровне инструкций».