Относительно избиения лиц под ЦИК в ноябре 2004 года органы милиции возбудили два уголовных дела по ст.293 Уголовного кодекса Украины (хулиганство). Затем органы прокуратуры переквалифицировали их в массовые беспорядки — ст.294 УК Украины — и передали в производство к следователю отдела УСБУ в Киеве. По результатам расследования в части доказанности вины отдельных лиц Служба безопасности Украины направила материалы в суд. В отдельное производство выделены уголовные дела относительно лиц, объявленных в розыск. Об этом говорится в совместном сообщении СБУ и МВД.
Дело относительно отравления в то время кандидата в президенты Украины В.Ющенко было возбуждено 21.09.04 г. Генеральной прокуратурой и 22.09.04 г. принято в производство следственными органами СБУ. 24.09.04 г. уголовное дело направили в Генпрокуратуру, которая проводит его дальнейшее расследование.
Уголовное дело о посягательстве на территориальную целостность Украины возбуждено Службой безопасности Украины 29.11.04 г. по ч.2 ст.110 Уголовного кодекса в связи с заявлениями отдельных представителей власти и других лиц относительно отделения юго-восточных регионов от нашего государства. Во время следствия было установлено, что такие заявления провозглашали отдельные лица, занимающие ответственные должности, и представители органов местной власти, поэтому, согласно действующему законодательству, 22.12.04 г. уголовное дело передано для проведения досудебного следствия в Генеральную прокуратуру Украины.
Уголовное дело о вмешательстве в работу сервера ЦИК возбудила Служба безопасности Украины 3 декабря 2004 г. В связи с тем, что в ходе досудебного следствия были собраны доказательства, свидетельствующие, что к совершению преступления причастны лица, должности которых отнесены к І—ІІІ категориям должностей госслужащих, уголовное дело 07.04.05 г., в соответствии с требованиями Уголовно-процессуального кодекса Украины, также направлено в Генпрокуратуру.