Шипулін дебютував за збірну Росії на Кубку світу в 2009 році. За цей час він здобув 11 особистих перемог. Всього на його рахунку 43 потрапляння на подіум на етапах Кубка світу.
За підсумками чотирьох сезонів він входив в топ-3 загального заліку Кубка світу (2017/18 – 3 місце, 2016/17 – 2 місце, 2015/16 – 3 місце, 2014/15 – 2 місце). У сезоні-2014/15 став володарем малого Кришталевого глобуса в заліку гонок з загального старту.
Він є олімпійським чемпіоном Сочі-2014 в естафеті, володарем "бронзи" Ванкувера-2010 у цій же дисципліні.
У 2017 році Шипулін в складі російської команди виграв "золото" в естафетній гонці на чемпіонаті світу в Хохфільцені.
Раніше повідомлялося про те, що чотири країни попросили виключити Росію з Кубка світу з біатлону.