Ученые из США и Японии предложили новую концепцию древа жизни, которая учитывает данные последних геномных исследований. О работе ученых сообщает N+1.
Как отмечают ученые, описание родства организмов значительно продвинулось с тех пор, как для него стали использовать не физические и метаболические характеристики, а генетические исследования, в частности, РНК малой субъединицы рибосом.
По состоянию на сентябрь 2015 года Обобщенная база данных микробных геномов Объединенного геномного института содержит наследственную информацию 30 437 видов организмов из всех трех надцарств: бактерий, архей и эукариот. Эти данные получены как секвенированием ДНК отдельных клеток, так и метагеномными исследованиями, при которых генетическая информация извлекается непосредственно из образцов в окружающей среде, и из полученных фрагментов ДНК реконструируются целые геномы.
Исследователи использовали как базы данных генетической информации, так и 1011 новых геномов, обнаруженных ими в различных природных образцах. Они выстроили и объединили наборы из 16 рибосомальных белковых последовательностей каждого организма, что позволило повысить разрешение итогового дерева жизни и дополнительно защитить его от ошибок. В дерево включили по одному представителю всех биологических родов, для которых секвенированы высококачественные геномы (всего 3083 организма).
Ранее сообщалось о том, что биологи из США разработали "Древо жизни" около 2,3 миллионов живых организмов, включая животных, растения, грибы и микроорганизмы. Проект представляет собой описание эволюционных связей между видами и является первым этапом на пути создания каталога для исследования 3,5 миллиардов лет эволюции жизни на Земле.