Російський бізнесмен Борис Березовський підозрює екс-майора Управління держохорони України Миколи Мельниченка в роботі на Федеральну службу безпеки Росії. «За вбивством (Георгія Гонгадзе - ред.) стояло тодішнє вище керівництво України. Вважаю, що злочинці досі на волі - і ті, хто замовляв, і ті, хто організовував ... Охочим або, може, неохочим замовником міг бути президент України Леонід Кучма. Неохочим тому, що, знаючи його, ніколи не бачив у ньому кровожерливих прагнень. Тут же і пан Литвин недалеко. І, звичайно ж, виконавець - «двічі самовбивця» пан Кравченко», - сказав Березовський. Щодо Кучми, Березовський сильно сумнівається, що він давав наказ вбивати журналіста: «Тому що ця історія була способом контролю Кучми». На питання, чи вважає Березовський в такому випадку Кремль замовником вбивства Гонгадзе, він відповів, що «ця ситуація була використана для того, щоб підставити Кучму. Я чув ці слова Кучми про Гонгадзе, але мені категорично важко стверджувати, що саме він це замовив. Інша справа, що все це підхопили і реалізували - це вже була провокація ФСБ». Березовський пояснив, чому його Фонд громадянських свобод дав майору-втікачу, якого він вважає агентом ФСБ, грант на розшифрування його плівок: «На початку цієї історії Мельниченко виставляв себе поборником правди, а в кінці він виявився абсолютним зрадником. Ви пам'ятаєте його заяви, коли він просив мене допомогти йому вивезти його з Польщі. Я тоді послав туди літак і охоронців. А потім він став розповідати, що я провокую весь цей скандал, всю цю історію». Торкаючись фінансування Мельниченка, Березовський заявив: «Фонд цивільних свобод дійсно платив якусь стипендію Мельниченку, який говорив, що йому нема на що жити. Це факт. Ми оплачували витрати, пов'язані з розшифруванням плівок. Це теж факт. Я не знаю, скільки їх було - 100 тисяч, 200 тисяч, - але я цього не заперечую». Нагадаємо, журналіст Георгій Гонгадзе зник у Києві 16 вересня 2000 року. У листопаді того ж року в лісі Київської області було знайдено труп з відтятою головою, який, за висновками експертів, міг належати журналістові. У 2008 році троє колишніх співробітників департаменту зовнішнього спостереження і кримінальної розвідки МВС України - полковники Валерій Костенко і Микола Протасов, майор Олександр Попович - були визнані винними в скоєнні вбивства журналіста і засуджені до термінів від 12 до 13 років позбавлення волі. Колишній начальник Департаменту зовнішнього спостереження МВС Олексій Пукач тривалий час знаходився в розшуку, і в липні 2009 року був затриманий у Житомирській області спільними зусиллями Генпрокуратури і СБУ. З 23 липня за рішенням суду він перебуває під вартою. 14 вересня Генпрокуратура заявила, що завершує досудове слідство у справі про вбивство Гонгадзе. Слідство встановило, що Пукач отримав наказ убити журналіста від екс-глави МВС Юрія Кравченка. Проте вже 17 вересня заступник генпрокурора Ренат Кузьмін продовжив термін слідства в справі Пукача до 14 грудня 2010 року. 8 жовтня був змінений слідчий у справі Георгія Гонгадзе. Слідчу групу замість Олександра Харченка очолив Владислав Грищенко. Новому генеральному прокурору Віктору Пшонці від попередника дістанеться десяток незавершених резонансних справ, серед яких справа Гонгадзе.
За матеріалами Сегодня