Йому інкримінується розкрадання коштів у сумі 243 мільйонів гривен шляхом використання підконтрольних підприємств при закупівлі в Держкомрезерв 22 150 тонн цукру. Кримінальну справу порушено за ознаками злочину, що передбачений ч. 5 ст. 191 Карного кодексу України.
Раніше, 28 січня в СБУ повідомили про затримання Нікітіна в якості підозрюваного у рамках розслідування кримінальної справи, порушеної за фактами розкрадання державних коштів на суму більше 7 мільярдів гривен, у тому числі виявлених міжнародними аудиторськими організаціями під час перевірки використання урядом України бюджетних коштів у 2008-2009 роках і в першому кварталі 2010 року.
Віталій Нікітін був призначений замголови Держкомрезерву 6 лютого 2008 року за розпорядженням прем'єр-міністра Юлії Тимошенко. 7 квітня 2010 року - був звільнений прем'єр-міністром Миколою Азаровим.