Ученые из Массачусетского технологического института обнаружили не имеющие хвоста ДНК-содержащие бактериофаги, которые не удавалось находить с помощью стандартных методов. По мнению исследователей, они могут преобладать в Мировом океане. О своем открытии ученые сообщили в журнале Nature.
В ходе исследования ученые изучили пробы воды, взятой у североамериканского побережья Атлантического океана. Они искали вирусы, содержащие двухцепочечную ДНК – такие вирусы чрезвычайно широко распространены, к ним относится и герпес, и бактериофаг Т4 (Caudovirales). Заразив культуры морских бактерий Vibrionaceae, ученые обнаружили 200 различных ДНК-содержащих вирусов, из которых 18 были отнесены к новому порядку Autolykiviridae.
Название группы отсылает к герою греческой мифологии Автолику, ловкому вору, которого столь же трудно поймать, как и эти вирусы.
"Бесхвостые" бактериофаги Autolykiviridae отличаются небольшим размером генома – всего порядка 10 тысяч оснований, в 4-5 раз меньше, чем у "хвостатых" родственников. Необычной оказалась и их способность инфицировать и убивать бактериальные клетки. Если обычные фаги в экспериментах поражали, как правило, один определенный вид вибрионов, эти заражали в среднем четыре и приводили к заметно более высокой смертности клеток.
"Они оказались ответственны за 40% смертности бактерий, хотя составляли около 10% от общего числа вирусов в пробе", – объясняет одна из авторов работы.
Эти цифры указывают на большую роль, которую новая группа Autolykiviridae играет в регуляции бактериальных популяций и в биосфере в целом. Ученые уверены, что их методика позволит найти прежде ускользавшие от обнаружения вирусы и в почве, а возможно – и в кишечнике человека. Сходные генетические последовательности действительно находятся в геномах бактерий человеческой микрофлоры.
Ранее сообщалось о том, что ученые успешно испытали прививку от ВИЧ. Ученые научили иммунную систему грызунов распознавать частицы ВИЧ с помощью "коктейля" из особых белков, похожих по структуре на части оболочки вируса.