Сотрудники Института Крейга Вентера (США) с помощью новой, относительно простой методики сумели синтезировать полный митохондриальный геном мыши.Весной этого года американские генетики, напомним, воссоздали геном бактерии Mycoplasma mycoides. Тогда «сборку» последовательности ученые начали с 1 078 отдельных фрагментов длиной в 1 080 пар оснований. Контролировать соединение столь крупных сегментов и обнаруживать ошибки было довольно сложно.
На первом этапе нового эксперимента использовались гораздо более короткие отрезки длиной в 60 нуклеотидов, объединяя которые генетики получили 75 фрагментов размером в 284 пары оснований. Эти кусочки исследователи поместили в клетки бактерий Escherichia coli и разработали автоматизированную методику секвенирования, выделявшую те получаемые «клоны», которые соответствовали последовательности митохондриального генома. «В нашем опыте ошибки отфильтровывали E. coli», — комментирует руководитель группы Дэниел Гибсон.
Точные копии постепенно объединялись друг с другом с образованием все более крупных фрагментов, и всего через несколько дней ученые синтезировали полный геном размером в 16 300 пар оснований.
Методика, эффективная и в меру простая, в скором времени будет применяться на практике. Недавно Институт Крейга Вентера и компания Synthetic Genomics, также основанная Вентером, создали новую небольшую компанию Synthetic Genomics Vaccines, которая, как следует из названия, займется изготовлением вакцин. «Вирус гриппа мутирует, и нам необходимо следить за его изменением, — говорит Гибсон. — Теперь мы получаем возможность быстро синтезировать новые варианты вируса и разрабатывать соответствующие вакцины».По материалам Компьюленты
